Майя, Рицуко, Мари и другие союзники исследуют странный обелиск, появившийся из ниоткуда. Его черная верхушка возвышается над всеми зданиями. Используя портативный компьютер, Майе удается подключиться к структуре и активировать ее. Однако они не уверены, каким будет результат. Тем временем Мари изо всех сил пытается сдержать появившихся евангелионов. С трудом ей удается победить врагов. Но появление третьей волны становится полной неожиданностью, потому что новая модель - 4444, c сильнее и мощнее, чем раньше.
Она вооружена позитронной пушкой, которая получает энергию от генератора Евангелиона 44b. Мари при поддержке своих друзей и с помощью Эйфелевой башни побеждает последнего врага. Теперь все находятся в полной боевой готовности. Активированный столб - это гигантская версия запечатывающих столбов, которые помогут в восстановлении города и появлении боевых трофеев. План заключается в модернизации устаревшего оружия и создании нового, чтобы раз и навсегда положить конец противостоянию Евангелиона, определив сильнейшего лидера…