Ангелы, мощные инопланетные боевые машины, во второй раз появились в Токио в 2015 году. Единственная надежда человечества - Евангелионы, человекоподобные боевые машины, разработанные специальным агентством nerv. Способные противостоять любой атаке ангелов, Евангелионы имеют одну особенность: этими роботами может управлять ограниченное число людей. Оружием, способным дать достойный отпор монстрам, стали боевые роботы категории evangelion, созданные гениальными учеными с помощью современных технологий. но управлять уникальными биороботами могли только отдельные пилоты, способные преодолеть процедуру синхронизации с evangelion. Только горстка 14-летних подростков, родившихся через девять месяцев после прибытия ангелов, способна взаимодействовать с Евангелионом. Один из таких пилотов - Синдзи Икари, чей отец возглавляет команду «нервов», которая проектирует и разрабатывает евангелионов. Брошенный в водоворот битвы и непонятных ему событий, главный герой вынужден обратиться к глубинам собственной силы и мужества, чтобы не только сражаться, но и выжить или потерять все.